Sí, de hecho es habitual que el número de usuarios de una misma empresa varíe según los módulos,
Por ejemplo:
Una empresa puede tener 50 empleados para el módulo de marcajes porque todos sus trabajadores tienen que fichar para tener el control horario y el registro de la jornada laboral, pero que solo 20 de ellos utilicen el módulo de proyectos y que a nivel de acceso solo 15 usuarios que son los que pueden acceder a una zona determinada.